Kurz Bioinženýrství II prohlubuje znalosti základů chemického inženýrství, Bioinženýrství I a je orientován jak na inženýrskou, tak i na biologickou podstatu procesů. Je založen na jednotkových operacích průmyslového biotechnologického procesu. Sestává z výukových jednotek: Charakteristika toku fází v bioreaktorech. Míchání v bioreaktorech. Aerace a přenos kyslíku v bioreaktorech. Průmyslové bioreaktory, Konstrukce bioreaktorů, konstrukční materiál. Pomocná zařízení. Doprava médií. Měření, regulace a řízení procesů. Aseptické bioreaktory. Fyziologický stav mikroorganismů. Buněčný transport, Kinetika enzymových reakcí. Stechiometrie růstu mikroorganismů. Kinetika mikrobiálního růstu a tvorby metabolitů. Matematické modely růstu mikroorganismů a tvorby produktů (+ přehled o optimalizačních metodách. Simulační jazyk PSI). Média, jejich příprava a sterilace. Sterilace vzduchu, Základní kultivační techniky: vsádková, fed-batch, kontinuální kultivace a zvláštní způsoby kultivace (povrchová kultivace, kultivace s recyklem buněk, kultivace na rozhraní hydrofilní a hydrofobní fáze, kultivace rostlinných a živočišných buněk, produkce látek pomocí imobilizovaných buněk). Separační techniky používané při izolaci produktů a výběr separační metody: Membránové separace. Elektroseparační procesy.Separace podle měrných hmotností. Chromatografické metody a výměna iontů. Adsorpce, Extrakce, Odpařování, Destilace, Dezintegrace. Metody izolace bílkovin (enzymů).