Detail předmětu
Biochemie II
FCH-MC_BCH2Ak. rok: 2025/2026
Obsah předmětu:
Úvod do metabolismu, metabolické dráhy, termodynamika živých systémů. Základní krátkodobé a dlouhodobé regulační mechanismy - regulace nezymové aktivity, regulace genové exprese, buněčná signalizace. Metabolismus sacharidů – glykolýza, fermentace. Metabolismus glykogenu. Glyoxalátový cyklus. Cyklus trikarboxylových kyselin. Glukoneogeneze. Biologické oxidace. Dýchací řetězec. Fotosyntéza. Metabolismus lipidů a mastných kyselin. Obecná izoprenoidní dráha, metabolismus cholesterolu. Dusíkaté látky I - Metabolismus aminokyselin, močovinový cyklus. Dusíkaté látky II - Porfyriny, biosyntéza a odbourání hemu. Regulace intermediárního metabolismu živin. Neurohumorální systém. Mechanismus účinku hormonů. Metabolismus nukleotidů.
Přednáška - týdenní rozpis:
1. Regulace metabolických procesů 1: mechanismy regulace enzymové aktivity (allosterie, kovalentní modulace); buněčná signalizace.
2. Regulace metabolických procesů 2: regulace genové exprese; řízení obratu proteinů.
3. Struktura a metabolismus sacharidů – glykolýza, typy fermentace a jejich průmyslové využití. Produkty fermentace.
4. Syntéza a odbourávání glykogenu, komplexní regulace. Polysacharidy.
5. Cyklus trikarboxylových kyselin. Glukoneogeneze, glyoxalátový cyklus. Ketonové látky.
6. Biologické oxidace. Transport elektronů a oxidační fosforylace – průběh, redoxní centra a jejich funkce, regulace dráhy a propojení s intermediárním metabolismem živin.
7. Fotosyntéza – průběh a regulace (oxygenní, anoxygenní).
8. Metabolismus lipidů, beta-oxidace mastných kyselin, biosyntéza mastných kyselin.
9. Obecná izoprenoidní dráha. Metabolismus cholesterolu.
10. Metabolismus dusíkatých látek 1: fixace dusíku, odbourání aminokyselin, močovinový cyklus. Přeměny uhlíkatého skeletu AK. Biosyntéza aminokyselin.
11. Metabolismus dusíkatých látek 2: Aminokyseliny jako biosyntetické prekurzory. Metabolismus porfyrinů.
12. Metabolismus nukleotidů. Biosyntéza a degradace nukleotidů a nukleových kyselin.
13. Primární a sekundární metabolismus. Sekundární metabolity mikroorganismů a rostlin.
Cvičení - koná se 1x za 2 týdny, 2 hodiny
- Regulace metabolismu přehledně; test - opakování Biochemie I; enzymová katalýza
- Metabolismus sacharidů 1; test - struktury a reakce monosacharidů, polysacharidů
- Metabolismus sacharidů 2; test - struktura a reakcereakce organických kyselin
- Biologické oxidace - fotosyntéza, repirace.; test - redoxní systémy živých organismů, bioenergetika
- Metabolismus lipidů a isoprenoidů; test - struktury a reakce mastných kyselin, lipidů, izoprenoidů
- Metabolismus dusíkatých látek; test - struktury a reakce aminokyselin a metabolitů od nich odvozených
Jazyk výuky
Počet kreditů
Garant předmětu
Zajišťuje ústav
Vstupní znalosti
Pravidla hodnocení a ukončení předmětu
Zkouška z Biochemie II je výhradně ústní, student dostane kombinaci tří otázek pokrývajících celou problematiku.
Hodnocení cvičení: aktivní účast ve výuce, diskusní příspěvky. Absolování 5 krátkých průběžných testů o rozsahu cca 6 otázek na struktury a reakce biochemikálií, z každého je třeba získat 65 % bodů.
Účast na přednáškách není povinná, ale doporučuje se v souvislosti s přímou návazností na cvičení. Účast na cvičení je povinná a bude kontrolovaná.
Učební cíle
V rámci cvičení budou diskutována jednotlivá témata v rozsahu hodinové dotace a budou doplněny prezentacemi studentů na dalé téma.
Posluchači získají podrobnější přehled o chemických dějích probíhajících v živých buňkách v průběhu jejich životních funkcí a o způsobech regulace těchto reakcí na buněčné i molekulární úrovni. Získané znalosti jsou základním východiskem pro studium dalších disciplin, zejména biotechnologických a bioinženýrských.
Základní literatura
Doporučená literatura
Zařazení předmětu ve studijních plánech
- Program NPCP_CHCHTE magisterský navazující 2 ročník, zimní semestr, povinný
- Program NKCP_CHCHTE magisterský navazující 2 ročník, zimní semestr, povinný
- Program NPCP_CHMA magisterský navazující
specializace BF , 1 ročník, zimní semestr, povinný
specializace CHBL , 1 ročník, zimní semestr, povinný - Program NKCP_ECHT magisterský navazující 1 ročník, zimní semestr, povinně volitelný
- Program NPCP_ECHT magisterský navazující 1 ročník, zimní semestr, povinně volitelný
- Program NPCP_CHPL magisterský navazující 1 ročník, zimní semestr, povinný
- Program NKCP_CHPL magisterský navazující 1 ročník, zimní semestr, povinný
- Program NPCP_PCHBT magisterský navazující 1 ročník, zimní semestr, povinný
Typ (způsob) výuky
Přednáška
Vyučující / Lektor
Osnova
Cílem předmětu je seznámit studenty se základy buněčného metabolismu a jeho regulacemi. Na základě obecných principů biochemické termodynamiky budou probírány základní dráhy metabolismu sacharidů, mastných kyselin a aminokyselin. Součástí předmětu jsou dále biologické oxidace, tvorba buněčné energie a fotosyntéza. V rámci metabolismu nukleových kyselin a bílkovin bude vysvětlen průběh genové exprese a jeho regulace. Součástí předmětu jsou i vzájemné vztahy a regulace v rámci intermediárního metabolismu živin.
V rámci cvičení budou diskutována jednotlivá témata probíraná v přednáškách, a to v rozsahu hodinové dotace. Kruhové diskuse budou doplněny prezentacemi studentů na dané téma.
Přehled výuky dle týdenního harmonogramu:
1. týden: Základní principy výstavby živých systémů. Základy metabolismu – opakování.
2. týden: Regulace metabolických procesů 1: mechanismy regulace enzymové aktivity (allosterie, kovalentní modulace); buněčná signalizace.
3. týden: Regulace metabolických procesů 2: regulace genové exprese; řízení obratu proteinů.
4. týden: Metabolismus sacharidů - glykolýza, typy fermentace a jejich průmyslové využití. Produkty fermentace.
5. týden: Metabolismus fruktosy a galaktosy. Syntéza a odbourávání glykogenu + komplexní regulace. Polysacharidy.
6. týden: Cyklus trikarboxylových kyselin. Glukoneogeneze.Ketonové látky.
7. týden: Biologické oxidace. Transport elektronů a oxidační fosforylace – průběh, redoxní centra a jejich funkce, regulace dráhy a propojení s intermediárním metabolismem živin.
8. týden: Fotosyntéza – průběh a regulace (oxygenní, anoxygenní).
9. týden: Metabolismus lipidů, beta-oxidace mastných kyselin, biosyntéza mastných kyselin. Metabolismus lipidů a fosfolipidů.
10. týden: Obecná izoprenoidní dráha. Metabolismus cholesterolu.
11. týden: Metabolismus dusíkatých látek 1: fixace dusíku, odbourání aminokyselin, močovinový cyklus. Přeměny uhlíkatého skeletu AK. Biosyntéza aminokyselin (sirné, aromatické).
12. týden: Metabolismus dusíkatých látek 2: Aminokyseliny jako biosyntetické prekurzory. Metabolismus porfyrinů. Metabolismus nukleotidů. Biosyntéza a degradace nukleotidů a nukleových kyselin.
13. týden: Sekundární metabolismus. Sekundární metabolity rostlin, mikroorganismů, živočichů – přehled. Produkce vybraných sekundárních metabolitů – vitaminy, antibiotika, aromatické sloučeniny, přírodní barviva, alkaloidy, steroidy, glykosidy, terpenoidy.
Cvičení
Vyučující / Lektor
Osnova